miércoles, 22 de julio de 2020

Secuenciación en Hepatitis Alcohólica

Título: Caracterización de la microbiota intestinal en pacientes alcohólicos con y sin hepatitis alcohólica
Resumen: El método fue la secuenciación de alto rendimiento con la tecnología Illumina MisSeq, la región analizada fue el ARN ribosómico 16S V3-V4 bacteriano obtenido de la muestra fecal. Las lecturas se ensamblaron con PANDAseq v 2.7, para generar la secuencia de un amplicón de 450 pares de bases. El número medio de lecturas de calidad controladas fue 26008-8106.69 por muestra, la diversidad alfa bacteriana se estimó sobre la base del índice de Shannon. Como resultado se encontraron 17 géneros diferentes en HA, entre ellos con más frecuencia Klebsiella, Enterococcus y Sphingomonas.

perl/bioinfo: Secuenciación de amplicones y genotipado de alto ...

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